登記識別情報と登記済証の違いは何ですか？

一番の違いは、その写しが有効かどうかということです。登記済証は、登記完了を証する法務局の赤い印が押してあり、そのコピーは次回の登記には使用できません。

登記識別情報は、１２桁の番号が合ってさえいれば、コピーでもメモでも有効です。これは、そもそも、登記のオンライン申請をすることを前提に作られた制度で、オンライン申請をする時は、この番号だけ提供すれば足りることになります。